De doelstellingen van de basisvorming - toepassing, vaardigheden en samenhang - krijgen bij het onderwijs in de afzonderlijke vakken en in projecten op het niveau van het atheneum betekenis. De onderwijsvernieuwing komt tot uiting in de vernieuwde didactiek en de gekozen lesmethoden. In de eerste klas worden in de studielessen door de mentoren algemene studievaardigheden behandeld, zoals bijv. op efficiënte wijze huiswerk maken. De mentor maakt in de studielessen ook de koppeling naar de vakspecifieke studievaardigheden, zoals bijv. het memoriseren van woordjes, studerend lezen, samenvatten, raadpleging en vergelijking van bronnen.In de onderbouw ligt de nadruk op het aanleren van kennis, vaardigheden en attitude. Studiewijzers in de eerste klas helpen bij het plannen: het meeste werk kan op school in de mediatheek worden gedaan, een uitvallende les scheelt zo in het huiswerk. Aan het einde van de derde klas dienen die studiegewoonten en vaardigheden op een zodanig peil te zijn, dat een overstap naar de Tweede Fase en een weloverwogen keuze voor een profiel mogelijk zijn.